在南安进行计算机软件著作权登记办理的过程中，申请者可能会面临一些挑战。然而，通过合理的应对策略，这些挑战是可以克服的。

首先，挑战之一是申请材料的准备。由于泉州著作权登记涉及多个方面的材料，申请者可能需要花费一定的时间和精力来收集和整理。为了应对这一挑战，申请者可以提前了解所需的材料清单，并逐一核对确保无误。同时，也可以寻求专业的知识产权代理机构或律师的帮助，以获取更准确的指导和建议。

其次，审查过程中的不确定性也是一个挑战。在审查阶段，登记机构可能会对申请材料的真实性、完整性以及是否符合著作权法的要求进行严格的评估。如果申请材料存在问题或不符合要求，可能会导致申请被驳回或需要补充材料。为了应对这一挑战，申请者应在提交申请前仔细核对材料的准确性和完整性，并尽量提前预留足够的时间来处理可能出现的补充材料要求。

此外，对于部分申请者来说，了解并遵守著作权法的相关规定也是一个挑战。著作权法涉及众多复杂的条款和规定，申请者可能需要花费一定的时间来学习和理解。为了应对这一挑战，申请者可以参加相关的培训课程或咨询专业的知识产权律师，以加深对著作权法的理解和应用。

在面对这些挑战时，申请者应保持积极的心态和耐心。同时，也可以考虑寻求专业的帮助和支持，以更好地应对和解决办理过程中遇到的问题。

综上所述，虽然南安计算机软件著作权登记办理过程中可能会面临一些挑战，但通过合理的准备和应对策略，申请者可以克服这些困难，成功完成著作权登记，为软件作品的保护和发展提供有力保障。